پس از جفت‌کردن Nintendo Switch Joy-Con باید در صفحه Change Grip/Order نحوه استفاده را نیز مشخص کنید؛ کنسول از جفت‌سازی به‌تنهایی نمی‌فهمد دو جوی‌کان یک دسته مشترک هستند یا هرکدام افقی و جدا استفاده می‌شوند.

• از منوی HOME وارد Controllers و سپس Change Grip/Order شوید.
• برای استفاده به‌صورت یک دسته دو‌تکه، L و R یا ZL و ZR را هم‌زمان فشار دهید.
• برای استفاده افقی و جداگانه، روی هر Joy-Con دکمه‌های SL و SR را بزنید.
• روشن‌ماندن چراغ بازیکن، ثبت و شماره کنترلر را نشان می‌دهد.
• حالت نگه‌داشتن پشتیبانی‌شده را در راهنمای همان بازی بررسی کنید.

این تنظیم برای جابه‌جایی سریع میان بازی تک‌نفره و چندنفره محلی مفید است و از شناسایی اشتباه دو کنترلر به‌عنوان یک دسته جلوگیری می‌کند.